Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms