Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms