Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms