Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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