Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms