Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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