Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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