Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIP4Q15650 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms