Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms