Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms