Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RTP5Q14D33 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTP5Q14D33 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms