Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1D2Q14995 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms