Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP1BQ14684 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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