Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms