Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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