Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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