Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms