Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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