Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
NME3Q13232 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NME3Q13232 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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NME3Q13232 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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