Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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