Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEMA3BQ13214 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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