Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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