Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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