Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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