Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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