Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms