Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP1Q09161 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP1Q09161 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms