Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms