Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms