Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms