Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms