Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXM1Q08050 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms