Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLEQ07864 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms