Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms