Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms