Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms