Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPCQ03188 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms