Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms