Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms