Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU5F1Q01860 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms