Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms