Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms