Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAP1Q01518 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAP1Q01518 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAP1Q01518 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAP1Q01518 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAP1Q01518 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAP1Q01518 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms