Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms