Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms