Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK6Q00534 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms