Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL1Q00532 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms