Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms