Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO4P98177 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms