Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELF3P78545 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELF3P78545 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELF3P78545 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELF3P78545 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELF3P78545 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms